Le Dr Margaret Chan, ressortissante de la République populaire de Chine, est entrée au Département de la Santé de Hong Kong en 1978. En 1994, elle est nommée Directeur de la Santé à Hong Kong, fonction qu'elle assumera neuf ans.
Entrée à l'Organisation Mondiale de la Santé (OMS) en 2003, le Dr Chan a d'abord occupé le poste de Directeur du Département Protection de l’environnement humain. En juin 2005, elle a été nommée Directeur "Maladies transmissibles : surveillance et action", et Représentant du Directeur général chargé de la grippe pandémique, confronté au syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS).
Élue Directeur général de l'OMS le 9 novembre, le Dr Chan a pris ses fonctions le 4 janvier 2007; son mandat prendra fin en juin 2012. Elle a été désignée suite du décès inopiné du Directeur général en fonction, le Dr Lee Jong-wook, le 22 mai 2006.
Le Dr Margaret Chan est diplômée de médecine de l’University of Western Ontario au Canada, et titulaire d’un diplôme de santé publique de la National University de Singapour.